Société africaine de génétique humaine

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Société africaine de génétique humaine
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La Société africaine de génétique humaine (African Society of Human Genetics, AfSHG ) est une société savante et une organisation professionnelle axée sur l'étude de la génétique humaine et de la génomique chez les Africains, et ouverte aux chercheurs intéressés par le sujet. Elle joue un rôle dans la fondation de plusieurs sociétés nationales de génétique et elle est affiliée aux sociétés du Cameroun, de la République démocratique du Congo, du Mali, de l'Égypte, du Rwanda, du Sénégal, de l'Afrique du Sud et de la Tanzanie.

En tant que berceau de l' Homo sapiens, l'Afrique abrite la plus grande diversité génétique humaine (en). Le continent est également confronté à une charge de morbidité élevée. Malgré ces facteurs, la recherche génétique sur le continent est insuffisante et aucune organisation existante n’est suffisamment dédiée à cette tâche. Tenant sa conférence inaugurale à Accra, au Ghana, la Société est fondée en 2003 pour accroître la capacité de recherche en Afrique, soutenir les chercheurs africains et améliorer la recherche sur les Africains. Depuis lors, lui et son projet phare (H3Africa (en)) sont des facteurs importants dans la croissance de la recherche génomique en Afrique.

Mission[modifier | modifier le code]

Bien que l'Afrique abrite la plus large gamme de variations génétiques humaines (en), elle est à la traîne par rapport à l'Occident en matière de recherche biomédicale et nombre de ses pays ne disposent pas de départements de génétique humaine. L'AfSHG est créée en 2003 pour donner aux scientifiques et aux décideurs politiques africains les connaissances et l'infrastructure nécessaires pour contribuer à la recherche génomique, promouvoir les chercheurs africains au niveau international et « favoriser la recherche en génétique en Afrique afin de générer des connaissances pour la prévention des maladies et la promotion de la santé. " [1]. Elle vise également à créer des sociétés de génétique humaine au niveau national et à fournir un environnement dans lequel les scientifiques africains peuvent réseauter et collaborer[2].

Histoire[modifier | modifier le code]

L'AfSHG est créée pour combler une lacune dans la recherche sur la génétique humaine en Afrique. La majeure partie de la formation en génomique et en bio-informatique est concentrée dans quelques établissements et dépend fortement de l'expertise des chercheurs européens et américains ; De nombreux Africains qui ont suivi une formation supérieure à l’étranger reviennent et découvrent que leur pays d’origine ne dispose que de peu d’infrastructures ou de financements pour poursuivre leurs recherches[3]. Les scientifiques décident qu’aucune autre organisation ou conférence n’est capable de répondre au besoin d’une meilleure recherche génétique, génomique et biomédicale sur le continent, ni de remédier à son manque de capacité de recherche[4]. La Société est créée en 2003 et Charles Rotimi est élu premier président [4],[5]. Sa conférence inaugurale s'est tenue les 8 et 9 décembre à Accra, au Ghana et elle est soutenue par une subvention rédigée par Rotimi, Clement Adebamowo (en) et Adebowale Adeyemo (en) ; le thème inaugural est « La recherche biomédicale en Afrique avec un accent sur la génétique »[4].

Depuis sa création, l'AfSHG participe à la création de sociétés au niveau national et à la coordination de projets internationaux. La cinquième réunion s'est tenue au Caire, en Égypte, en 2007, conjointement avec la première réunion de la Société nationale égyptienne de génétique humaine (NSHG) ; là, la Société propose le projet qui est finalement devenu H3Africa[6]. La sixième réunion, tenue en 2009 à Yaoundé, au Cameroun, inaugure la Société camerounaise de génétique humaine (CSHG)[6]. À cette époque, l’AfSHG compte plus de 400 membres issus de 24 pays (16 en Afrique, 8 ailleurs)[7]. La Société crée des groupes de travail sur les maladies transmissibles et non transmissibles, dirigés respectivement par Sékou F. Traoré et Bongani Mayosi (en)[4]. Après la réunion, Philip Mjwara, directeur général du Département sud-africain de la science et de l'innovation, exhorte la Société sud-africaine de génétique humaine (SASHG), qui existe depuis 1986 [2], à s'affilier à l'AfSHG[6].

La septième réunion s'est tenue au Cap en 2011, conjointement avec le SASHG. Introduit par les exposés de Rotimi et Michèle Ramsay, elle se concentre sur l'importance d'étudier la diversité génétique chez les Africains et sa relation avec la prédisposition aux maladies, et sur la manière de mener de telles études sur le continent[8]. La neuvième réunion, tenue à Dakar au Sénégal en 2016, aboutit à la création de la Société sénégalaise de génétique humaine (S2HG) [2]. Il s'agit de la première réunion de l'AfSHG à se tenir dans un pays exclusivement francophone, marquant une étape importante : le Sénégal, avec 12 autres pays africains, utilise le français dans le monde universitaire[2].

L'AfSHG retourne au Caire pour sa réunion de 2017. La principale conclusion est que les chercheurs doivent redoubler d’efforts pour combler le fossé en matière de recherche entre l’Afrique et les autres continents[9]. Chaque année, la fuite des cerveaux coûte au continent environ 20 000 scientifiques vers les pays à revenus plus élevés. Pour y mettre fin, il faudrait renforcer et étendre les infrastructures et capacités de recherche existantes et créer des opportunités locales[9]. Lors de la conférence suivante, tenue à Kigali, au Rwanda, en 2018, la Société souligne de nouveau l'importance du développement des infrastructures et des ressources grâce aux investissements des gouvernements locaux et à une collaboration accrue entre les institutions à travers l'Afrique[10].

En 2021, l’AfSHG est l’un des facteurs moteurs de la croissance de la génomique en Afrique[11]. Bien que le continent développe un noyau solide de professionnels de la génomique, les chercheurs font écho aux appels à un financement accru en Afrique de la part des secteurs philanthropique, public et privé, et à un investissement accru dans les systèmes de soins de santé pour la recherche translationnelle (en)[11]. Son président, Ambroise Wonkam, propose également que la prochaine initiative scientifique majeure de la Société soit le séquençage de trois millions de génomes africains – le projet Three Million African Genomes (en) (Trois millions de génomes africains, 3MAG) – afin de couvrir le spectre de la variation génétique humaine en Afrique[12]. L'organisation appelle à la fin du racisme dans la science en août 2022, déclarant que « Black Lives Matter et Black Research Matters »[13]. En particulier, il appelle à la fin de la recherche héliportée sur la génomique africaine et à davantage de recherches dirigées et financées par les Africains[13].

H3Africa[modifier | modifier le code]

Lors de la réunion du Caire en 2007, les membres conviennent que l'AfSHG devra diriger un projet sur le génome africain (AGP) ; le discours d'ouverture, intitulé "L'Afrique et la révolution du génome", est prononcé par Francis Collins, qui est l'un des dirigeants du Projet du génome humain[4]. L'AGP comportera quatre volets : la génétique des populations, la génétique médicale, la formation et l'infrastructure. Parmi ses objectifs, il s'agira d'échantillonner au moins 100 groupes ethniques du continent, de développer des ressources à grande échelle pour étudier l'interaction gènes-environnement des maladies en Afrique, de former des scientifiques africains et d'établir des laboratoires et des capacités de recherche locales[4]. Lors de la réunion de Yaoundé en 2009, le concept AGP est rebaptisé « Hérédité humaine et santé en Afrique » (Human Heredity and Health in Africa, H3Africa) pour refléter ses objectifs et sa portée[4].

Les National Institutes of Health (NIH) des États-Unis et le Wellcome Trust du Royaume-Uni annoncent un financement initial pour H3Africa à Londres en 2010[4]. À la suite des délibérations de l'AfSHG en 2011 à Yaoundé et à Oxford, les chercheurs publient le livre blanc H3Africa[14]. Dans le cadre de cette initiative, l'AfSHG développera une base de données de toutes les universités, institutions et scientifiques travaillant sur la génétique humaine en Afrique[15]. Les premiers enquêteurs de H3Africa se réunissent en 2012 à Addis-Abeba, en Éthiopie[4]. L’initiative a depuis créé de nombreuses biobanques et référentiels, des pôles bioinformatiques et des programmes de formation en génétique humaine[3].

En 2020, H3Africa a publié son article marquant dans Nature – une analyse du génome complet de 426 individus issus de 50 groupes ethnolinguistiques en Afrique, y compris des populations jusqu'alors non échantillonnées [16] – et environ 300 autres manuscrits décrivant de nouvelles données et résultats[17]. Cet article constitue une étape majeure pour la génomique africaine : il découvre des millions de nouvelles variantes génétiques et la plupart de ses auteurs sont basés dans des institutions africaines[18].

Sociétés membres[modifier | modifier le code]

  • Société Camerounaise de Génétique Humaine (CSHG) [19]
  • Société Congolaise de Génétique Humaine (CoSHG) [19]
  • Société Malienne de Génétique Humaine (MSHG) [19]
  • Société nationale de génétique humaine d'Égypte (NSHG) [19]
  • Société Rwandaise de Génétique Humaine (RSHG) [19]
  • Société Sénégalaise de Génétique Humaine (S2GH) [19]
  • Société d'Afrique australe de génétique humaine (SASHG) [19]
  • Société tanzanienne de génétique humaine (TSHG) [20]

Réunions[modifier | modifier le code]

N° Ville hôte Pays Année Thème Ref.
1 Accra Drapeau du Ghana Ghana 2003 Recherche biomédicale en Afrique avec accent sur la génétique [21]
2 Washington, D.C. Drapeau des États-Unis USA 2004 Soutenir la Société africaine de génétique humaine [21]
3 Johannesbourg Drapeau d'Afrique du Sud South Africa 2005 Variation génétique humaine en Afrique [21]
4 Addis Ababa Drapeau de l'Éthiopie Ethiopia 2006 Variation génétique humaine et maladie [21]
5 Le Caire Drapeau de l'Égypte Egypt 2007 La recherche en génomique en Afrique : implications pour le diagnostic des maladies, le traitement et le développement de médicaments [21]
6 Yaoundé Drapeau du Cameroun Cameroon 2009 Origine humaine, diversité génétique et santé [21]
7 Cape Town Drapeau d'Afrique du Sud South Africa 2011 Renforcer les capacités de recherche génomique et translationnelle en Afrique [21]
8 Accra Drapeau du Ghana Ghana 2013 Faire progresser la recherche en génomique en Afrique : Une conférence conjointe de l'AfSHG et du consortium H3Africa [21]
9 Dakar Drapeau du Sénégal Senegal 2016 Renforcer la recherche en génétique humaine en Afrique [21]
10 Le caire Drapeau de l'Égypte Egypt 2017 Génétique humaine et génomique en Afrique : Défis pour les maladies génétiques rares et communes [21]
11 Kigali Drapeau du Rwanda Rwanda 2018 Renforcer les compétences et les ressources pour la recherche en génomique, épigénétique et bioinformatique en Afrique [21]
12 Bamako Drapeau du Mali Mali 2019 La génétique et la génomique humaine comme facteur d'unité pour l'harmonie et le progrès en Afrique [22]
13 Dar es Salaam Drapeau de la Tanzanie Tanzania 2021 La génomique et la recherche translationnelle pour améliorer la santé en Afrique [21]
14 Rabat Drapeau du Maroc Morocco 2022 Applications de la médecine génomique en Afrique [23]

Présidents[modifier | modifier le code]

Références[modifier | modifier le code]

(en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « African Society of Human Genetics » (voir la liste des auteurs).
  1. ↑ « About AfSHG », African Society of Human Genetics (consulté le )
  2. ↑ a b c et d « Strengthening human genetics research in Africa: report of the 9th meeting of the African Society of Human Genetics in Dakar in May 2016 », Glob Health Epidemiol Genom, vol. 2,‎ , e10 (PMID 29868221, PMCID 5870411, DOI 10.1017/gheg.2017.3)
  3. ↑ a et b « Genomics and bioinformatics capacity in Africa: no continent is left behind », Genome, vol. 64, no 5,‎ , p. 503–513 (PMID 33433259, DOI 10.1139/gen-2020-0013, S2CID 231585632)
  4. ↑ a b c d e f g h i j k et l Charles N. Rotimi, The Genetics of African Populations in Health and Disease, , 320–330 p. (ISBN 9781139680295, DOI 10.1017/9781139680295.014, S2CID 212853942, lire en ligne), « Enabling Genomic Revolution in Africa »
  5. ↑ « Inauguration of the African Society of Human Genetics », Nat Genet, vol. 36, no 6,‎ , p. 544 (PMID 15167923, DOI 10.1038/ng0604-544, lire en ligne)
  6. ↑ a b et c « Inauguration of the Cameroonian Society of Human Genetics », Pan Afr Med J, vol. 3,‎ , p. 8 (PMID 21532717, PMCID 2984290, DOI 10.4314/pamj.v3i1.52447)
  7. ↑ « Report on the 6th African Society of Human Genetics (AfSHG) Meeting, March 12-15, 2009, Yaounde, Cameroon », Am J Trop Med Hyg, vol. 83, no 2,‎ , p. 226–9 (PMID 20682860, PMCID 2911163, DOI 10.4269/ajtmh.2010.10-0208)
  8. ↑ « Exploring genomic studies in Africa », Genome Med, vol. 3, no 7,‎ , p. 45 (PMID 21745422, PMCID 3221546, DOI 10.1186/gm261)
  9. ↑ a et b « Developing a Road Map to Spread Genomic Knowledge in Africa: 10th Conference of the African Society of Human Genetics, Cairo, Egypt », Am J Trop Med Hyg, vol. 102, no 4,‎ , p. 719–723 (PMID 32124726, PMCID 7124895, DOI 10.4269/ajtmh.19-0408)
  10. ↑ « Building Skills and Resources for Genomics, Epigenetics, and Bioinformatics Research for Africa: Report of the Joint 11th Conference of the African Society of Human Genetics and 12th H3Africa Consortium, 2018 », Am J Trop Med Hyg, vol. 102, no 6,‎ , p. 1417–1424 (PMID 32207403, PMCID 7253097, DOI 10.4269/ajtmh.19-0837)
  11. ↑ a et b « Has translational genomics come of age in Africa? », Hum Mol Genet, vol. 30, no 20,‎ , R164–R173 (PMID 34240178, DOI 10.1093/hmg/ddab180)
  12. ↑ « Sequence three million genomes across Africa », Nature, vol. 590, no 7845,‎ , p. 209–211 (ISSN 0028-0836, PMID 33568829, PMCID 9979155, DOI 10.1038/d41586-021-00313-7, Bibcode 2021Natur.590..209W, S2CID 231882443)
  13. ↑ a et b Wonkam, Bardien, Diallo et Gaye, « "Black Lives Matter and Black Research Matters": the African Society of Human Genetics' call to halt racism in science », Molecular Biology of the Cell, American Society for Cell Biology (ASCB), vol. 33, no 9,‎ , vo2 (ISSN 1059-1524, PMID 35862495, PMCID 9582635, DOI 10.1091/mbc.e22-04-0122)
  14. ↑ « African genomes », Current Biology, vol. 21, no 13,‎ , R481–R484 (ISSN 0960-9822, DOI 10.1016/j.cub.2011.06.047)
  15. ↑ (en) H3Africa Working Group Harnessing Genomic Technologies Toward Improving Health in Africa: Opportunities and Challenges (rapport), (lire en ligne, consulté le )
  16. ↑ « High-depth African genomes inform human migration and health », Nature, vol. 586, no 7831,‎ , p. 741–748 (PMID 33116287, PMCID 7759466, DOI 10.1038/s41586-020-2859-7, Bibcode 2020Natur.586..741C)
  17. ↑ « Africans begin to take the reins of research into their own genomes », Science,‎ (ISSN 0036-8075, DOI 10.1126/science.abg8903, S2CID 234061688)
  18. ↑ « Africa's people must be able to write their own genomics agenda », Nature, vol. 586, no 7831,‎ , p. 644 (ISSN 0028-0836, PMID 33116292, DOI 10.1038/d41586-020-03028-3, Bibcode 2020Natur.586..644.)
  19. ↑ a b c d e f et g « Member societies », African Society of Human Genetics (consulté le )
  20. ↑ « Tanzania », African Society of Human Genetics (consulté le )
  21. ↑ a b c d e f g h i j k et l (en) « Conferences », African Society of Human Genetics (consulté le ).
  22. ↑ (en) Ibrahim Dia, « 12th conference of the AfSHG: "Genetics and Human Genomics as a Unifying factor for Harmony and Progress in Africa" », University of Science, Technology and Technologies of Bamako, (consulté le ).
  23. ↑ (en) « 14th Meeting of the AfSHG Agenda », African Society of Human Genetics, (consulté le ).
  24. ↑ (en) « Committees », www.afshg.org (consulté le )
  25. ↑ (en-US) « afshg-cairo017.org », afshg-cairo017.org (consulté le )

Liens externes[modifier | modifier le code]

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